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在水厂养殖中，虽然磷酸盐对鱼类没有毒性，但是磷酸盐偏高却能导致水中藻类大量繁殖，间接影响鱼的生长。一般情况下，当磷酸盐检测值达到1mg/L时，水质将宜于藻类繁殖；当磷酸盐水平达到2–3mg/L或更高时，藻类生长将难以控制，藻类爆发随时可能发生，因此，理想的磷酸盐水平应该是0.05mg/L以下。 环境监测中的监测分析方法应根据监测项目的要求和实际情况，选择适用范围符合要求的标准。《水质 总磷的测定 钼酸铵分光光度法》（GB 11893-1989）的测定项目是总磷不是磷酸盐，不能用于磷酸盐测定。《生活饮用水卫生标准检验方法》（GB/T 5750-2006）系列方法适用于生活饮用水的监测，不适用废水磷酸盐的测定。 目前并磷酸盐测定的钼酸铵分光光度法的国家生态环境监测标准，现可查询到的磷酸盐生态环境监测标准有《水质 磷酸盐的测定 离子色谱法》（HJ 669-2013）和《水质 磷酸盐和总磷的测定 连续流动-钼酸铵分光光度法》（HJ 670-2013）两个。另外还有《水和废水监测分析方法》（第四版增补版）中也有可适用的磷酸盐测定方法。 
废水磷酸盐超标的去除方法 1.生化法。这是一种常见、低成本、高处理率的方法，也是目前备受欢迎，及污水处理的发展趋势。这种方法是利用聚磷菌及反硝化聚磷菌的原理让水中磷被消耗或转化，其除磷率可达到70%以上。
2.吸附除磷法。这种是利用活性碳、活性氧化铝等材料对废水中的含磷物质进行物理性吸附，以此减少污水中磷的含量。这种方法主要依靠净水材料的吸附性，消耗材料费用较高。 3.化学除磷法 。它是通过投加化学除磷剂药剂，使之与水中污染物发生化学反应，生成难溶性磷酸盐，再通过固液分离的方法，达到除磷的目的。这种方法具有沉降速度快，适用性强，成本低，见效快的优点。
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