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医疗废水来源及成分复杂，含有病原性微生物、有毒、有害的物理化学污染物和放射性污染等，具有空间污染、急性传染和潜伏性传染等特征，不经有效处理会成为一条疫病扩散的重要途径和严重污染环境： 1.医疗废水受到粪便、传染性细菌和病毒等病原性微生物污染，具有传染性，可以诱发疾病或造成伤害；
2.医疗废水中含有酸、碱、悬浮固体、BOD、COD和动植物油等有毒、有害物质；
3.牙科治疗、洗印和化验等过程产生污水含有重金属、消毒剂、有机溶剂等，部分具有致癌、致畸或致突变性，危害人体健康并对环境有长远影响；
4.同位素治疗和诊断产生放射性污水。放射性同位素在衰变过程中产生a-、β-和γ-放射性，在人体内积累而危害人体健康。 
医疗废水处理流程： 1.一级处理 医疗废水一级处理的典型工艺是一级沉淀加俏毒。此流程适用于污水排人市政下水道的医院，特别是一些综合医院。就我国目前的情况而言，大多数城市医院污水处理后是排人城市下水道，故通常只进行一级处理。但随着医院污水排放标准的提高，有些大城市医院也积极采用二级处理以确保处理后出水的水质。
2.二级处理
医疗废水二级处理通常为生物处理，常采用的处理方法有：生物转盘法、生物接触氧化法、射流曝气法、氧化沟法、塔式生物滤池法等。二级处理工艺适用于医疗废水排人地面水域的情况，可对污水的生物性污染、理化性污染及有毒有害物质进行全面处理。
3.消毒处理
医疗废水消毒处理方法很多，大致可分为物理方法和化学方法两大类。物理方法有辐射法、紫外线法、加热法、冷冻法等。化学方法包括用臭氧、重金属离子、阳离子表面活性剂等化学药剂处理。我国医疗废水处理应用最广泛的是氯化消毒，其中使用较多的次氯酸钠法，该法处理效果稳定、设备简单、基建投资省、占地面积少、运转费用低、管理安全方便。
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